Secara administratif kawasan TNKpS termasuk dalam Kabupaten Administrasi Kepulauan Seribu, tepatnya di tiga kelurahan yaitu Pulau Panggang, Pulau Kelapa, dan Pulau Harapan. Secara geografis Taman Nasional ini terletak pada 5024’ –5045’ LS dan 106025’ – 106040’ BT dan mencakup luas 107.489 ha (SK Menteri Kehutanan Nomor 6310/Kpts-II/2002), yang terdiri dari wilayah perairan laut seluas 107.489.ha (22,65% dari luas perairan Kabupaten Administrasi Kepulauan Seribu) dan 2 pulau (Pulau Penjaliran Barat dan Pulau Penjaliran Timur) seluas 39,50 ha. Perkembangan pembangunan di kawasan Kepulauan Seribu hingga saat ini cukup pesat, diantaranya peningkatan laju pertumbuhan penduduk yang tinggal di sekitar dan dalam kawasan, kegiatan pembangunan fisik yang dilandasi dengan pembangunan ekonomi, pembangunan wilayah Kabupaten Administrasi Kepulauan Seribu. Dikarenakan letaknya yang sangat strategis +50 km dari Jakarta dan kemudahan aksesibilitas), kawasan TNKpS menjadi primadona destinasi wisatawan khususnya wisata bahari Saat ini paradigma pengelolaan kawasan konservasi tidak hanya untuk tujuan konservasi semata dimana pengelolaan kawasan konservasi dikembangkan utamanya untuk perlindungan hidupan liar (conservation for protecting wildlife), namun kini konservasi juga mencakup tujuan sosial dan ekonomi (conservation for community welfare), restorasi, rehabilitasi dan tujuan-tujuan sosial ekonomi dan budaya.
Balai Taman Nasional Kepulauan Seribu mendapatkan mandat untuk turut serta berperan dalam mensukseskan 3 Prioritas Nasional (PN)yaitu Pariwisata, Kemaritiman dan Kelautan, Desa dan Kawasan Pedesaan. Untuk mendukung Kepulauan Seribu sebagai salah satu Destinasi Wisata Prioritas Nasional, Balai Taman Nasional Kepulauan Seribu berencana mengembangkan wisata alam di kawasan Taman Nasional dengan mengembangkan sarana prasarana untuk pariwisata alam di Pulau Pramuka yang merupakan salah satu pulau dengan pengunjung terbanyak di Kepulauan Seribu. Dengan pengembangan sarana prasarana wisata alam ini diharapkan selain sebagai PNBP dari sektor pariwisata juga bisa membangun sosial ekonomi bagi masyarakat yang ada di Pulau Pramuka dan pulau sekitarnya dan mengedukasi pengunjung untuk ikut serta dalam pelestarian alam
